Contabilidade de clínicas médicas em São Luís

São Luís, capital do Maranhão, se consolida como um dos polos de saúde mais importantes da região Nordeste. A cidade conta com hospitais de referência, clínicas especializadas e uma rede crescente de serviços médicos, atraindo tanto pacientes locais quanto de outras cidades do estado e da região.

Nesse cenário de crescimento, muitos médicos estão optando por abrir suas próprias clínicas, buscando mais autonomia, liberdade profissional e retorno financeiro. 

No entanto, para que a clínica funcione de forma segura e dentro da legalidade, é fundamental cuidar de um aspecto que, muitas vezes, acaba sendo negligenciado: a contabilidade.

É aqui que entra a AJMED Contabilidade, referência nacional em contabilidade para médicos e clínicas de saúde, que agora também atende com excelência os profissionais de São Luís e região.

Neste artigo, vamos mostrar como funciona a contabilidade para clínicas médicas na capital maranhense, quais são as etapas para abrir sua clínica, as obrigações fiscais, os regimes tributários aplicáveis e os erros que você pode evitar ao contar com uma contabilidade especializada na área da saúde.

Por que clínicas médicas em São Luís precisam de uma contabilidade especializada?

Muitos médicos e gestores ainda veem a contabilidade apenas como uma obrigação para gerar guias de impostos, emitir notas fiscais ou enviar declarações. Na prática, a contabilidade de uma clínica médica vai muito além disso.

O setor da saúde possui particularidades que exigem atenção redobrada, como:

• Tributação diferenciada, com possibilidade de pagar menos impostos, desde que seja feito o planejamento correto;

• Aplicação do Fator R, que pode reduzir significativamente os tributos ou, se não observado, gerar custos muito mais altos;

• Gestão da folha de pagamento médica, que, se não estruturada corretamente, pode gerar alta carga tributária sobre pró-labore e colaboradores;

• Emissão correta de NFS-e, mesmo quando há repasse de convênios;

• Envio obrigatório da DMED (Declaração de Serviços Médicos e de Saúde), que permite o cruzamento de informações pela Receita Federal;

• Gestão inteligente do pró-labore e da distribuição de lucros, para otimizar a carga tributária;

• ISS com regras específicas na cidade de São Luís, que precisam ser analisadas corretamente.

Além disso, uma clínica médica é uma empresa como qualquer outra e precisa de planejamento, controle financeiro, análise de resultados e suporte na tomada de decisão.

Contar com uma contabilidade especializada, como a AJMED, significa não apenas evitar riscos fiscais, mas também economizar dinheiro todos os meses, operando de forma segura e sustentável.

Etapas para abrir uma clínica médica em São Luís

Se você está planejando abrir sua clínica médica em São Luís, é fundamental seguir um processo de legalização completo, bem estruturado e, acima de tudo, alinhado às normas locais.

Veja as principais etapas que a equipe da AJMED Contabilidade executa com agilidade e segurança:

✔ 1. Escolha da natureza jurídica

As clínicas médicas podem ser abertas nos seguintes formatos:

• Sociedade Limitada (LTDA): exige dois ou mais sócios, sejam médicos ou investidores;

• Sociedade Limitada Unipessoal (SLU): permite que você abra a clínica sozinho, com separação patrimonial e proteção dos seus bens pessoais.

A definição da natureza jurídica impacta diretamente na gestão da clínica, na responsabilidade civil e na organização tributária.

✔ 2. Definição do regime tributário

A escolha do regime tributário é um dos pontos mais estratégicos, pois influencia diretamente no quanto sua clínica pagará de impostos.

Os principais regimes para clínicas médicas em São Luís são:

• Simples Nacional: alíquota inicial de 6%, podendo chegar até mais de 19%, dependendo do Fator R;

• Lucro Presumido: alíquota entre 13,33% e 16,33%, dependendo do ISS municipal;

• Lucro Real: regime mais complexo, indicado apenas em casos muito específicos.

👉 A AJMED faz simulações personalizadas, comparando os regimes e indicando aquele que oferece a maior economia tributária possível, de acordo com o perfil e o faturamento da clínica.

✔ 3. Registro e licenciamento

Para funcionar legalmente, sua clínica precisa passar pelos seguintes processos:

• Registro na Junta Comercial do Estado do Maranhão (JUCEMA);

• Obtenção do CNPJ junto à Receita Federal;

• Inscrição Municipal na Prefeitura de São Luís;

• Solicitação do Alvará de Localização e Funcionamento;

• Obtenção da Licença Sanitária, emitida pela Vigilância Sanitária Municipal;

• Emissão do AVCB (Auto de Vistoria do Corpo de Bombeiros), se exigido;

• Cadastro no sistema da Prefeitura para emissão de Nota Fiscal de Serviços Eletrônica (NFS-e).

A equipe da AJMED Contabilidade acompanha cada etapa do processo, garantindo que sua clínica seja aberta de forma rápida e sem complicações.

Regimes tributários: como as clínicas médicas em São Luís são tributadas?

A depender do porte da clínica, do volume de faturamento e da estratégia fiscal adotada, você pode optar por um dos regimes abaixo:

✔ Simples Nacional

É uma opção interessante para clínicas de pequeno e médio porte, mas exige atenção ao Fator R.

• Anexo III: alíquota inicial de 6%, quando o gasto com folha (pró-labore e funcionários) é igual ou superior a 28% do faturamento.

• Anexo V: alíquota inicial de 15,5%, se o gasto com folha não atingir esse percentual.

A diferença entre os anexos pode significar economia de milhares de reais todos os meses, por isso, o planejamento do pró-labore é fundamental.

✔ Lucro Presumido

Bastante utilizado por clínicas que saem do Simples Nacional. A carga tributária é, geralmente, composta por:

• 11,33% de tributos federais sobre o faturamento;

• ISS entre 2% e 5%, dependendo da legislação de São Luís.

Vantagem: não depende do Fator R, e em muitos casos oferece economia superior ao Simples.

Por que escolher a AJMED para a contabilidade da sua clínica em São Luís?

A AJMED Contabilidade é uma empresa 100% especializada em médicos, clínicas, consultórios e empresas da área da saúde.

Ao contratar a AJMED em São Luís, sua clínica tem acesso a:

• ✔ Abertura de CNPJ e legalização completa, incluindo todas as licenças;

• ✔ Planejamento tributário inteligente para pagar menos impostos de forma legal;

• ✔ Gestão contábil, fiscal e financeira especializada no setor de saúde;

• ✔ Organização do pró-labore, folha de pagamento e distribuição de lucros;

• ✔ Emissão correta de notas fiscais e gestão da DMED;

• ✔ Relatórios financeiros claros, que ajudam na tomada de decisões;

• ✔ Atendimento humanizado, focado exclusivamente em profissionais da área médica.

Conclusão

A contabilidade de clínicas médicas em São Luís é muito mais do que simplesmente gerar guias de impostos. 

É um serviço estratégico que, quando bem executado, permite que sua clínica pague menos impostos, evite riscos fiscais, opere dentro da legalidade e cresça com total segurança.

Se você é médico ou gestor de clínica médica em São Luís e busca uma contabilidade especializada, moderna e que realmente entende as particularidades do setor de saúde, fale agora com a AJMED Contabilidade.

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Bruno Nascimento

Fundador e CEO da AJMED – Contabilidade Médica e euContador – Contabilidade Digital, tendo mais de 20 anos de experiência no mercado contábil. Possui mais de 3500 alunos, 250 CNPJs sob gestão e mais de 200 médicos em seu escritório. Possui a formação Academia de Contabilidade Médica, que forma centenas de alunos todos os anos.